由于母亲工作的缘故，伊东诚悟来到了神那岛。他重逢了儿时曾来岛上游玩过的青梅竹马服部彩，以及幼年时随父亲移居到岛上的妹妹美琴。尽管生活中仍有各种问题，但他逐渐开始适应岛上的生活。 就在某天，诚悟在神那学院后山的深处遇见了一位手持日本刀的神秘少女——加纳佳代子。不仅如此，他还被金发双马尾的风纪委员篠原圣良盯上，在追逐的过程中，又邂逅了身为学生会长的千金小姐内海静菜。 与她们的相遇，将会把诚悟的学院生活引向何方？